Ziel des Akademienvorhabens ist es, die gesamte überlieferte Korrespondenz Haeckels (Briefe und Gegenbriefe) im Volltext verfügbar zu machen. Aufgrund der großen Menge an Korrespondenzstücken ist die Publikationsstrategie des Projektes hybrid angelegt und umfasst zwei komplementäre Module:
1. die vollständige Wiedergabe der textkritisch bearbeiteten Transkription und Online-Publikation der gesamten Korrespondenz (Briefe und Gegenbriefe) inklusive Metadaten als Volltext abruf- und recherchierbar
2. eine umfassend historisch-kritisch bearbeitete, mit kontextualisierenden Stellenkommentaren versehene Printedition ausgewählter Briefwechsel in 25 Themenbänden, die die essentielle biographische, wissenschaftliche, literarisch-künstlerische, zeitgeschichtliche und politische Korrespondenz Haeckels verfügbar macht.